搜索
基因转录本的选择
很多小伙伴在第一步找目的基因信息的时候，经常会发现自己研究的基因居然有很多长短不一的转录本（transcript variant），以人的FMR1基因为例，如下图：
关于这个问题之前已经遇到无数小伙伴咨询了，大家都不知道转录本应该如何来选择，所以在这里分享几条经验，期望能对大家有所帮助。
1
人源基因的转录本选择
人源基因的转录本选择：
可以参考NCBI上新发布的MANE project（是特定有临床代表意义的转录本，一般人源基因会有这项标注）推荐转录本，这个可以作为基因功能研究的首选转录本。
NCBI上搜索目的基因以人的FMR1基因为例，选择NM_002024这个转录本，如图：
2
其他物种基因的转录本选择
对于小鼠或者大鼠亦或是其他物种基因没有1中的标注，可参考如下方案：
A. 过表达一般优先选择最长的来进行，可首选ORF转录本最长的那个。
B. 选转录本1号（variant 1），大部分情况人源基因转录本1同时具备以上说明的所有属性，既是NCBI MANE project推荐转录本，也是ORF最长的转录本。
C. 如果已经确认在某种细胞上做实验（如Hela细胞），直接设计可以扩增多个转录本的全长引物，做PCR来测序，测序出来的结果就是该细胞株中表达的转录本，这样选择虽然有点麻烦，但是信息会很准确。
D.咨询一下大的ORF克隆供应公司（如GeneCopoeia，OriGene等）或者直接在他们官网查询现货数据，查下他们那个转录本是现货的或者现货质粒种类最多的，说明已经用过的人很多，相信也就不难选择了。
THANKS
耐心是最好的老师，感谢您阅读到底，记得扫描关注我们哦，您的关注，是我们的最大动力！如果您觉得这篇文章对您有用，欢迎帮忙分享，您的分享，说不定可以帮到身边更多的人！
上海七纯生物科技有限公司
扫描左侧二维码
关注更多详情吧
手机扫码可直接访问该页面
首页
全部产品类目